传说中，原本的灯塔花园岛是一片荒芜，光秃秃的一片，几乎就是死地一片。但是，有一天，三位神联合出手了，将原来一片荒芜的大地化作最为肥沃的土地。风之神龙卷云招来了雨水，土之神土地云让植物生长，雷之神雷电云则是电击植物，让植物化作肥料回归大地，滋润着岛上的土地。
它们不断的加速着循环这一过程，直至岛上的每寸土地都长出了美丽的花海为止。然后它们将这里当做了他们的家，居住下来。一百年，两百年，三百年，它们以为会一直宁静祥和的过下去。
然而，有一天，大地之乡的王国发生了剧变！
王有一对双胞胎王子，两人都是具备智慧与勇气杰出的王子！
两位王子都有着优秀的资质！两人分别是得到黑之神择库洛姆认可的————理想的勇者！得到白之神雷希拉姆认可的————真实的勇者！
两位神只会将智慧和力量给予自己认可的人类！但是，在王国未来走向的问题上，两位王子都有着不同的意见，然后两人都必须面对王储的争夺，互相对立起来。
随着而来的便是惨烈的战争！而对于自己认可的人类，两位神不遗余力的帮助，开始了战斗。而这场战斗波及到小岛上的三位神，三位神对于这场战争也有了分歧。
土之神土地云认为，这场战争与它们没有任何关系；风之神龙卷云站在了白之神雷希拉姆的那一方；雷之神雷电云则是黑之神择库洛姆的那一边。然后风之神龙卷云与雷之神雷电云展开了战斗，由于战斗波及到了小岛，土之神土地云为了保护小岛，被迫加入了战斗。
那场战斗打的天昏地暗，激烈无比，但是那场战争却没有了胜利者。因为白之神与黑之神的战斗几乎摧毁了大地之乡，力量损耗殆尽的它们，自我封印了起来。
但是三位神却不知道它们已经自我封印，每天的战斗不断的持续，愈演愈烈，最后都力尽而竭，与黑之神白之神落得同样的下场，自我封印。
不过在土之神土地云保护下，小岛并没有遭到重创，很幸运的保留了下来。
“不过那五位神是哪里被封印了，如果有机会，我真想看看呢。”小智听着大叔的讲述，心中不由期待了起来。
“皮——卡——丘——”
“皮卡丘，你也想看吧。”小智摸了摸皮卡丘的小脑袋。
“据传说，土之神、雷之神和风之神被封印在了小岛上，而黑之神和白之神则是封印在了大地之乡。”大叔抖了抖烟斗，然后拿起一些烟丝放入烟斗中，不紧不慢的抽起来。一朵朵烟圈从大叔的口中吹了出来，显示他在抽烟上的实力。
“而且，据说土之神、雷之神和风之神就被封印在灯塔下面。不过传说到底还是传说，在灯塔地下挖掘了这么多年，根本什么都没有找到呢。这不得不说是一件非常让人遗憾的事呢。”大叔一边在烟中醉生梦死，一边毫不在意的爆着猛料，或者他只把它当做了一个故事，一个在灯塔花园岛世世代代流传的故事。
“那我一定要去灯塔的地下看看！对吧，皮卡丘！”
“皮——卡——丘——”
“大叔，最后的目的地就是灯塔了！”
但是，事实的真相真的如传说中的故事一样吗？这，谁也不知道。
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